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Modalità di Accesso ai Servizi

 

 

L’accesso ai servizi offerti dalla Piattaforma di Sequenziamento dovrà essere prenotato e concordato con il personale della piattaforma stessa, tenendo conto della complessità e della durata delle procedure sperimentali richieste.

Per tutti gli afferenti alla Piattaforma di Sequenziamento, si sottolinea che, se non diversamente concordato, la preparazione dei campioni, allestimento reazioni PCR e librerie di sequenziamento (incluso quantificazione e diluizione per caricamento) dovrà essere effettuato dal ricercatore che richiede il servizio.  

L’accesso ai servizi offerti dalla Piattaforma di Sequenziamento avviene secondo diverse modalità, come di seguito specificato:

  • Accesso gratuito per i ricercatori afferenti al Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica (Università di Firenze), ai quali potrà essere richiesto di provvedere al reintegro dei reagenti e materiali di uso comune; essi dovranno invece provvedere autonomamente a fornire o ad acquistare tutto il materiale non comune necessario per i loro specifici esperimenti.
  • Accesso a tariffa per i ricercatori afferenti ad altri dipartimenti dell’Università di Firenze, ad altri Atenei e centri pubblici di ricerca (es. CNR), ditte ed imprese private. 

In base alle esigenze individuali si potranno scegliere due distinte modalità:

  • tariffa a singola prestazione, computata in base ai costi effettivi dei reagenti di uso comune, del costo macchina e del costo orario del personale dedicato come riportato nella Tabella I.
  • tariffa ad abbonamento, per gli utenti che abbiano necessità di avvalersi in via continuativa dei servizi della piattaforma, computata secondo i criteri suddetti ed opportunamente scontata.

 

Tabella I. Tariffario per singola prestazione

Prestazione

Piattaforma

Costo (€) 

IVA esclusa

Referente

Contatto

Sequenziamento NGS 

(1 Flow-Cell)

Illumina NextSeq 2000

a partire da 100*

Prof. Alessandro M. Vannucchi

Prof.ssa Betti Giusti

Dr. Niccolò Bartalucci

amvannucchi@unifi.it

betti.giusti@unifi.it

niccolo.bartalucci@unifi.it

Sequenziamento Sanger 

(1 campione)

Applied Biosystems 3500 Dx Genetic Analyzer

a partire da 10

Prof. Alessandro M. Vannucchi

Prof.ssa Betti Giusti

Dr. Niccolò Bartalucci

amvannucchi@unifi.it

betti.giusti@unifi.it

niccolo.bartalucci@unifi.it

Trascrittomica a singola cellula 

A)Solo utilizzo strumento (1 campione)

B)Servizio esteso

BD Rhapsody HT Express

A) a partire da 80 **

B) da concordare***

Prof. Alessandro M. Vannucchi

Prof.ssa Betti Giusti

Prof.ssa Laura Maggi

Dr. Niccolò Bartalucci

Dr.ssa Anna Vanni

amvannucchi@unifi.it

betti.giusti@unifi.it

laura.maggi@unifi.it

niccolo.bartalucci@unifi.it

anna.vanni@unifi.it

 

 

 

 

* Qualora più campioni possano essere processati congiuntamente all'interno della medesima flow-cell, il costo verrà calcolato a livello di flow-cell e successivamente ripartito tra gli utenti in funzione del numero di campioni effettivamente analizzati. I costi riportati nel presente tariffario sono inoltre soggetti a una logica di ottimizzazione basata sul riempimento delle flow-cell. Qualora sia possibile aggregare più campioni sulla stessa flow-cell, il costo per campione potrà essere ridotto in funzione dell'effettivo utilizzo della capacità disponibile.

** L'utente porta il campione già pronto (sospensione cellulare alla concentrazione e vitalità corrette), esegue il passaggio nel BD Rhapsody HT Express e ritira il cDNA per procedere autonomamente a librerie e sequenziamento. I kit del Rhapsody sono a carico dell'utente. Il prezzo può variare in base al numero di campioni e alla possibilità di combinarli tra loro all’interno della cartuccia dello strumento.

*** Questa opzione si applica quando la piattaforma si fa carico di tutte o parte delle procedure del flusso di lavoro: dalla dissociazione o controllo qualità del campione iniziale, alla cattura su BD Rhapsody HT Express, fino alla preparazione delle librerie pronte da sequenziare. I kit restano a carico dell'utente. A causa delle variabili biologiche e della complessità dei protocolli (es. Whole Transcriptome Amplification, Targeted Panels, Multiplexing con Sample Tags o AbSeq per le proteine), questa voce non ha una tariffa fissa ma prevede una formulazione su preventivo.

 

Anche nella modalità a tariffa gli utenti dovranno provvedere autonomamente a fornire o ad acquistare tutto il materiale non comune necessario per i loro specifici esperimenti, oppure concordarne con il personale coordinatore i costi specifici che saranno aggiunti alla tariffa base.

Per i ricercatori afferenti a ditte ed imprese private sarà richiesta la stipula di un contratto di ricerca a titolo oneroso, da concordare tra le parti.

La riscossione delle tariffe pattuite e la stipula di contratti di ricerca sarà curata dal personale amministrativo del DMSC di supporto alla Piattaforma di Sequenziamento conformemente alle norme e regolamenti vigenti.

Tutte le attività che coinvolgano direttamente i ricercatori afferenti alla Piattaforma di Sequenziamento e che si configurino come collaborazioni scientifiche con personale di altri Dipartimenti, Atenei e centri di ricerca pubblici e privati sono esenti dall’applicazione delle tariffe.


Come citare la piattaforma 

Si richiede all’utente di riconoscere l’utilizzo delle strumentazioni e dei servizi della Piattaforma nelle pubblicazioni scientifiche, poster e comunicazioni a congressi che includano dati ottenuti grazie ad essa. 

  • Citazione della Piattaforma in Ringraziamenti (Acknowledgment)

The authors acknowledge the [name of research infrastructure], Dept. of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy, for skillful technical support.

  • Citazione della Piattaforma in Materiali e metodi (Methods)

…samples were acquired by [instrument], at [name of research infrastructure], Dept. of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy.

Ultimo aggiornamento

16.10.2026

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