Modalità di Accesso ai Servizi
L’accesso ai servizi offerti dalla Piattaforma di Sequenziamento dovrà essere prenotato e concordato con il personale della piattaforma stessa, tenendo conto della complessità e della durata delle procedure sperimentali richieste.
Per tutti gli afferenti alla Piattaforma di Sequenziamento, si sottolinea che, se non diversamente concordato, la preparazione dei campioni, allestimento reazioni PCR e librerie di sequenziamento (incluso quantificazione e diluizione per caricamento) dovrà essere effettuato dal ricercatore che richiede il servizio.
L’accesso ai servizi offerti dalla Piattaforma di Sequenziamento avviene secondo diverse modalità, come di seguito specificato:
- Accesso gratuito per i ricercatori afferenti al Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica (Università degli Studi di Firenze), ai quali potrà essere richiesto di provvedere al reintegro dei reagenti e materiali di uso comune; essi dovranno invece provvedere autonomamente a fornire o ad acquistare tutto il materiale non comune necessario per i loro specifici esperimenti.
- Accesso a tariffa per i ricercatori afferenti ad altri dipartimenti dell’Università degli Studi di Firenze, ad altri Atenei e centri pubblici di ricerca (es. CNR), ditte ed imprese private.
In base alle esigenze individuali si potranno scegliere due distinte modalità:
- tariffa a singola prestazione, computata in base ai costi effettivi dei reagenti di uso comune, del costo macchina e del costo orario del personale dedicato come riportato nella Tabella I.
- tariffa ad abbonamento, per gli utenti che abbiano necessità di avvalersi in via continuativa dei servizi della piattaforma, computata secondo i criteri suddetti ed opportunamente scontata.
Tabella I. Tariffario per singola prestazione
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Prestazione |
Piattaforma |
Costo (€) IVA esclusa |
Referente |
Contatto |
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Sequenziamento NGS (1 Flow-Cell) |
Illumina NextSeq 2000 |
a partire da 100* |
Prof. Alessandro M. Vannucchi Prof.ssa Betti Giusti Dr. Niccolò Bartalucci |
amvannucchi@unifi.it betti.giusti@unifi.it niccolo.bartalucci@unifi.it |
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Sequenziamento Sanger (1 campione) |
Applied Biosystems 3500 Dx Genetic Analyzer |
a partire da 10 |
Prof. Alessandro M. Vannucchi Prof.ssa Betti Giusti Dr. Niccolò Bartalucci |
amvannucchi@unifi.it betti.giusti@unifi.it niccolo.bartalucci@unifi.it |
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Trascrittomica a singola cellula A)Solo utilizzo strumento (1 campione) B)Servizio esteso |
BD Rhapsody HT Express |
A) a partire da 80 ** B) da concordare*** |
Prof. Alessandro M. Vannucchi Prof.ssa Betti Giusti Prof.ssa Laura Maggi Dr. Niccolò Bartalucci Dr.ssa Anna Vanni
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amvannucchi@unifi.it laura.maggi@unifi.it
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* Qualora più campioni possano essere processati congiuntamente all'interno della medesima flow-cell, il costo verrà calcolato a livello di flow-cell e successivamente ripartito tra gli utenti in funzione del numero di campioni effettivamente analizzati. I costi riportati nel presente tariffario sono inoltre soggetti a una logica di ottimizzazione basata sul riempimento delle flow-cell. Qualora sia possibile aggregare più campioni sulla stessa flow-cell, il costo per campione potrà essere ridotto in funzione dell'effettivo utilizzo della capacità disponibile.
** L'utente porta il campione già pronto (sospensione cellulare alla concentrazione e vitalità corrette), esegue il passaggio nel BD Rhapsody HT Express e ritira il cDNA per procedere autonomamente a librerie e sequenziamento. I kit del Rhapsody sono a carico dell'utente. Il prezzo può variare in base al numero di campioni e alla possibilità di combinarli tra loro all’interno della cartuccia dello strumento.
*** Questa opzione si applica quando la piattaforma si fa carico di tutte o parte delle procedure del flusso di lavoro: dalla dissociazione o controllo qualità del campione iniziale, alla cattura su BD Rhapsody HT Express, fino alla preparazione delle librerie pronte da sequenziare. I kit restano a carico dell'utente. A causa delle variabili biologiche e della complessità dei protocolli (es. Whole Transcriptome Amplification, Targeted Panels, Multiplexing con Sample Tags o AbSeq per le proteine), questa voce non ha una tariffa fissa ma prevede una formulazione su preventivo.
Anche nella modalità a tariffa gli utenti dovranno provvedere autonomamente a fornire o ad acquistare tutto il materiale non comune necessario per i loro specifici esperimenti, oppure concordarne con il personale coordinatore i costi specifici che saranno aggiunti alla tariffa base.
Per i ricercatori afferenti a ditte ed imprese private sarà richiesta la stipula di un contratto di ricerca a titolo oneroso, da concordare tra le parti.
La riscossione delle tariffe pattuite e la stipula di contratti di ricerca sarà curata dal personale amministrativo del DMSC di supporto alla Piattaforma di Sequenziamento conformemente alle norme e regolamenti vigenti.
Tutte le attività che coinvolgano direttamente i ricercatori afferenti alla Piattaforma di Sequenziamento e che si configurino come collaborazioni scientifiche con personale di altri Dipartimenti, Atenei e centri di ricerca pubblici e privati sono esenti dall’applicazione delle tariffe.
Come citare la piattaforma
Si richiede all’utente di riconoscere l’utilizzo delle strumentazioni e dei servizi della Piattaforma nelle pubblicazioni scientifiche, poster e comunicazioni a congressi che includano dati ottenuti grazie ad essa.
Citazione della Piattaforma in Ringraziamenti (Acknowledgment)
The authors acknowledge the [e.g., Imaging Platform or other platform], Department of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy, for skillful technical support.
Citazione della Piattaforma in Materiali e metodi (Methods)
…samples were acquired by [instrument], at [e.g., Integrated Imaging and Flow Cytometry Platform or other platform], Department of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy.
I servizi della PIATTAFORMA di IMAGING sono a titolo gratuito per i ricercatori afferenti al DMSC, in quanto i relativi costi gravano su una quota percentuale della dotazione dipartimentale per la ricerca di Ateneo che viene accantonata annualmente allo scopo.
Esempi di contributo richiesto per le prestazioni più comuni
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Metodica |
Ore (approssimative) |
Costo complessivo (€) |
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Supporto per l’allestimento di preparati per l’osservazione al m.o. da parte di utenti già esperti sulle metodiche (inclusione, taglio, colorazione, montaggio) |
1 |
50 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al m.o. colorati con metodi di routine (ematossilina-eosina o altra colorazione istologica) a partire da prelievo di tessuto fresco (inclusione, taglio, colorazione, montaggio); 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
2 |
100 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al m.o. (luce o fluorescenza) immunomarcati in fluorescenza o immunoenzimatica da prelievo di tessuto fresco (inclusione, taglio, colorazione, montaggio); 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
4 |
200 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al m.o. colorati con metodi di routine da prelievo di tessuto fresco, microfotografia ed analisi morfometrica (misura di aree, misura di intensità ottica) 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
5 |
250 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al microscopio confocale con immunomarcatura in fluorescenza da prelievo di tessuto fresco, microfotografia ed analisi morfometrica (misura di aree, misura di intensità ottica) 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
4 |
240 |
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Osservazione al microscopio confocale di preparati già allestiti dall’utente, microfotografia ed analisi morfometrica (misura di aree, misura di intensità ottica) 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
2 |
120 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al microscopio elettronico con metodi di routine (inclusione in resina, contrasto) a partire da prelievo di tessuto fresco (inclusione, ultramicrotomia, contrasto, microfotografia); 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
4 |
280 |
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Realizzazione di preparati per l’osservazione al microscopio elettronico di nanostrutture in contrasto negativo, con documentazione fotografica e morfometria; 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 trattato) |
2 |
140 |
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Realizzazione di preparati immunomarcati per l’osservazione al microscopio elettronico (inclusione, ultramicrotomia, immuno-elettromicroscopia, contrasto, microfotografia); 2 prelievi (es. 1 controllo, 1 immunomarcato) |
7 |
490
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Come citare la piattaforma
Si richiede all’utente di riconoscere l’utilizzo delle strumentazioni e dei servizi della Piattaforma nelle pubblicazioni scientifiche, poster e comunicazioni a congressi che includano dati ottenuti grazie ad essa.
- Citazione della Piattaforma in Ringraziamenti (Acknowledgment)
The authors acknowledge the [name of research infrastructure], Dept. of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy, for skillful technical support.
- Citazione della Piattaforma in Materiali e metodi (Methods)
…samples were acquired by [instrument], at [name of research infrastructure], Dept. of Experimental & Clinical Medicine, University of Florence, Italy.
Ultimo aggiornamento
16.10.2026